В отечественной стоматологии детского возраста выделяют три формы клинического течения ОГС: легкую, среднетяжелую и тяжелую.
Продромальный период легкой формы начинается с повышения температуры тела до 37,0–37,5 °C при общем удовлетворительном состояниии, соответственно, поведении ребенка. Возможно развитие регионарного лимфаденита. В полости рта появляются признаки диффузной гиперемии слизистой оболочки полости рта (СОПР), наблюдается локализованный катаральный гингивит.
В период разгара сохраняется субфебрильная температура тела и удовлетворительное самочувствие ребенка. На гиперемированной СОПР появляются одиночные элементы поражения (не больше пяти). При механическом, термическом и химическом воздействии на эпителий в этих участках возникает резкая боль, что ограничивает меню ребенка. Длительность периода (до нормализации температуры тела и проявления признаков трансформации эрозий в афты) в таких случаях не превышает 2 дней. Признаки лимфаденита и гингивита сохраняются.
Период угасания (эпителизации) характеризуется восстановлением нормального общего состояния ребенка и постепенным снижением болезненности при приеме пищи. Афты превращаются в пятна в течение 1–2 дней. Спустя несколько дней приходят в нормальное состояние десна и лимфоузлы.