Ферменты 1

ME = 1 мкмоль субстрата / мин

1 катал = 6 * 10^7 ME

1 МЕ = 16,67 * 10^-9 кат

в 10^8 - 10^10

Абсолютная субстратная специфичность – только на единственный субстрат (аргиназа, уреаза)

Стереоспецифичность – действует на определенный стереоизомер (L или D- ак, цис- или транс-): фумараза

Групповая специфичность – фермент действует на субстраты, имеющие определенный тип связи: липаза, пептидаза

Активность ферментов зависит от рН и температуры;

нет (кроме ферментов-самоубийц)

• Уровнем экспрессии (количеством фермента);

• Переходом из неактивного состояния в активное путем ограниченного протеолиза (переход профермента в фермент);

• 
  Аллостерически;

• 
  Путем обратимой ковалентной модификации (фосфорилирование/дефосфорилирование);

• 
  Белок-белковыми взаимодействиями (глюкокиназа).

Активный центр фермента – гидрофобный карман на поверхности молекулы, состоящий из а.о. способных связывать субстрат (центр связывания) и ансамбля а.о., непосредственно осуществляющих химическое превращение субстрата (каталитический центр)

Аллостерические центры – для связывания эффекторных молекул на поверхности фермента;

Присоединение регуляторных молекул к аллостерическому центру изменяет каталитическую активность фермента.

• Оксидоредуктазы – ферменты, катализирующие окислительно-восстановительные реакции (перенос электронов, гидрид-ионов или атомов водорода)

• 1.1 Действуют на СН-ОН группу;

• 1.1.1 С НАД+ или НАДФ+ в качестве акцептора;

• 1.1.1.1 Алкогольдегидрогеназа

• Оксидоредуктазы – ферменты, катализирующие окислительно-восстановительные реакции (перенос электронов, гидрид-ионов или атомов водорода)

• 1.2 Действуют на альдегидную или оксогруппу;

• 1.2.1 С НАД+ или НАДФ+ в качестве акцептора

• 1.2.1.12 Глицеральдегидфосфатдегидрогеназа

• Оксидоредуктазы – ферменты, катализирующие окислительно-восстановительные реакции (перенос электронов, гидрид-ионов или атомов водорода)

• 1.3 Действуют на СН-СН группу

• 1.4 Действуют на СН-NH2 группу

• 1.5 Действуют на СН-NH группу

• 1.6 Действующие на НАДН и НАДФН

2. Трансферазы – ферменты, катализирующие перенос функциональных групп и молекулярных остатков от одной молекулы к другой;

• 2.1 Переносящие одноуглеродные фрагменты

• 2.1.1 Метилтрансферазы

• 2.1.2 Трансферазы гидроксиметильных, формильных и родственных групп

• 2.1.2.1 Серин-гидроксиметилтрансфераза

• Трансферазы – катализирующие перенос функциональных групп и молекулярных остатков

• 2.2 Переносящие альдегидные и кетонные группы

• 2.3 Ацилтрансферазы

• 2.4 Гликозилтрансферазы

• 2.5 Переносящие алкильные или арильные группы, кроме метильной

• 2.6 Переносящие азотсодержащие группы

• 2.6.1 Трансаминазы

• 2.6.1.2 Аланинаминотрасфераза

3. Гидролазы – ферменты, катализирующие гидролиз ковалентной связи;

Лиазы – ферменты, катализирующие негидролитическое отщепление функциональной группы с

образованием двойной связи или присоединение группы по двойной связи;Систематическое название строится по схеме:

Расщепляемый субстрат – отщепляемая группа-лиаза

Изомеразы – ферменты, катализирующие различные типы реакций изомеризации

(эпимеризации, цис-транс изомеризации, кето-енольные превращения);

Систематическое название строится по схеме:
Субстрат реакция, где-обозначение, отражающее суть реакции (номер изменяемого атома углерода, цис-транс, кето-енол, альдозо-кетозо

Лигазы (синтетазы) – ферменты, катализирующие образование связей в реакциях конденсации, сопряженных с расщепление АТФ;